Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TULP1O00294 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TULP1O00294 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TULP1O00294 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TULP1O00294 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TULP1O00294 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP1O00294 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP1O00294 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP1O00294 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TULP1O00294 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP1O00294 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP1O00294 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP1O00294 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TULP1O00294 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TULP1O00294 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms