Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIP1O00291 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIP1O00291 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIP1O00291 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIP1O00291 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIP1O00291 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIP1O00291 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HIP1O00291 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIP1O00291 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIP1O00291 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIP1O00291 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIP1O00291 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIP1O00291 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIP1O00291 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIP1O00291 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HIP1O00291 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIP1O00291 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIP1O00291 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIP1O00291 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIP1O00291 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIP1O00291 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIP1O00291 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HIP1O00291 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIP1O00291 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIP1O00291 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIP1O00291 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIP1O00291 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIP1O00291 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms