Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DFFAO00273 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DFFAO00273 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DFFAO00273 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DFFAO00273 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DFFAO00273 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DFFAO00273 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DFFAO00273 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DFFAO00273 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DFFAO00273 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DFFAO00273 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DFFAO00273 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DFFAO00273 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DFFAO00273 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DFFAO00273 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DFFAO00273 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms