Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QQQ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QQQ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QQQ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QQQ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QQQ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms