Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H7C1H1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H7C1H1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H7C1H1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H7C1H1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H7C1H1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H7C1H1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H7C1H1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H7C1H1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms