Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H7C1D1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H7C1D1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H7C1D1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1D1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1D1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1D1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1D1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1D1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H7C1D1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H7C1D1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H7C1D1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
H7C1D1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H7C1D1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H7C1D1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H7C1D1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H7C1D1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H7C1D1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H7C1D1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms