Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PATL2C9JE40 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PATL2C9JE40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PATL2C9JE40 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms