Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERVV-2B6SEH9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVV-2B6SEH9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms