Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PP2D1A8MPX8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PP2D1A8MPX8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms