Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4orf47A7E2U8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4orf47A7E2U8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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