Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRN3P2A6NIE6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRN3P2A6NIE6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms