Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEMP2A6NFY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEMP2A6NFY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms