Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCAF2A6NFQ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCAF2A6NFQ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms