Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L4A6NEF3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L4A6NEF3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms