Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMNCA6NCL1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMNCA6NCL1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms