Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBA6A0AVT1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA6A0AVT1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms