Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms