Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWB2

TRBV7-9, T-cell receptor beta variable 7-9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-9A0A0J9YWB2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms