Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AIF1L-207ENST00000372309 3515 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 RINT1-201ENST00000257700 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 EDNRA-202ENST00000358556 3823 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE1-215ENST00000640055 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 AL031846.2-201ENST00000624656 3671 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 USHBP1-201ENST00000252597 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SMIM3Q9BZL3 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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