Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LYNX1-205ENST00000620006 868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 EIF3LP1-201ENST00000554099 1658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 OR6F1-203ENST00000641444 1698 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 BIN3-210ENST00000522268 321 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CACNA1SQ13698 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AGA-201ENST00000264595 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC084064.1-201ENST00000569938 419 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SCARB2-202ENST00000452464 1495 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 CTSLP1-201ENST00000457530 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CACNA1SQ13698 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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