Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK8P49336 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms