Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms