Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A1-202ENST00000398341 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TMEM100-205ENST00000575734 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC016831.5-201ENST00000605249 1998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8P7-201ENST00000443628 1948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LONP2-203ENST00000535754 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 INTS14-203ENST00000431261 1980 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms