Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 COL14A1-203ENST00000309791 6163 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
RETNLBQ9BQ08 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms