Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
TMEM225BP0DP42 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms