Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 EPB42-201ENST00000300215 4553 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RETNLBQ9BQ08 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms