Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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