Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OPALINQ96PE5 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OPALINQ96PE5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms