Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CUL4BQ13620 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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