Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms