Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJQ12913 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PTPRJQ12913 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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