Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMPOP42166 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms