Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC015959.1-201ENST00000623263 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PRSS2-206ENST00000633969 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms