Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYV3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYV3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYV3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYV3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
V9GYV3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
V9GYV3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYV3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYV3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms