Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms