Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AUP1Q9Y679 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AUP1Q9Y679 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms