Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX5Q9Y5X3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms