Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SNX13Q9Y5W8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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SNX13Q9Y5W8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX13Q9Y5W8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SNX13Q9Y5W8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX13Q9Y5W8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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