Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCAF1Q9Y4C2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF1Q9Y4C2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms