Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCN4Q9Y3Q4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms