Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms