Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAN1Q9Y2M0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms