Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERGIC3Q9Y282 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERGIC3Q9Y282 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms