Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms