Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HHLA3Q9XRX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HHLA3Q9XRX5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms