Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMC3Q9UQE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMC3Q9UQE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms