Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF9BQ9UPX0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF9BQ9UPX0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms