Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGTPBP1Q9UPW5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGTPBP1Q9UPW5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms