Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms