Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX12Q9UMY4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX12Q9UMY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX12Q9UMY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms